L’AEN assure la gestion de l’école et, à ce titre, est co-signataire avec le Directeur de la Source des Contrats d’Association avec l’Education Nationale.

Tous les parents d’élèves, actuels ou anciens peuvent être membres de l’association, de même que les professeurs, le personnel de l’établissement, et toute personne intéressée par les méthodes d’Education Nouvelle préconisées par François Chatelain et Roger Cousinet, fondateurs de la Source.

L’AEN est administrée par un Conseil d’Administration qui regroupe aux côtés de la Direction de l’école et de huit membres fondateurs, trois représentants des enseignants (un pour chaque niveau), ainsi que quatre représentants de l’Association des Parents d’Elèves (APE), et un représentant du personnel de l’établissement

Le Conseil d’Administration de l’AEN a pour rôle d’arrêter les grandes orientations mises en oeuvres par le Directeur - assisté des trois directrices de niveau - de veiller au développement du projet, à la bonne gestion administrative et financière, de représenter l’école auprès des autorités de tutelle, et de décider sur les questions essentielles concernant la stabilité et la pérennité de l’établissement.